Si están en el mismo servidor, y accedes con la misma conexión, simplemente se consulta indicando además de la tabla, la base:
Si tienes que acceder por conexiones diferentes o en servidores diferentes, no se puede. Al menos no en MySQL usando consultas.
De todos modos ten en cuenta que si el proyecto crece, siembre habrá un momento en que un hosting gratuito no te sirva y debas usar uno pago. Y en ese caso el tema cambia completamente.