Siempre que he tenido que trabajar en Windows suelo instalar los paquetes ya compilados de aquí:
http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/
En especial MySQL nunca lo he logrado instalar correctamente de otra forma (bueno, tampoco lo intenté mucho, pero si he leído que da muchos problemas).
Saludos
