¿que opcion prefieren?

[pzin]

Si te pregunta es hacerlo así:

Código PHP:

<div id="conte_encabezado">
<? include('encabezado.php'); ?>
</div>
 

o así:

Código PHP:

<? include('encabezado.php'); ?>
 

encabezado.php:

Código PHP:

<div id="conte_encabezado">
<!-- contenido -->
</div>
 

Yo optaría por la segunda opción, incluir el div en el propio archivo del encabezado; menos código a escribir.