Cita:
Iniciado por edward18_1 
Gracias y bueno con tu respuesta veo que si es posible entonces subir archivos encriptados al servidor
La verdad no lo he echo y desconozco si se pueda
pero la pregunta sería y ¿Por que dices que pueden afectar al servidor?
Recuerda que un archivo no se puede ejecutar por si solo, ya que debe de haber un proceso especifico en el sistema operativo para poder abrirlo o solo que lo leas con el lenguaje del lado del servidor solo de esa forma puedes leer o ejecutar el contenido del archivo.
Lo que te recomiendo es que tengas una buena validación al momento de subir los documentos al servidor, de esa forma podrás evitar algún tipo de bug en tu sistema.
Saludos.