Hola compi,
No tienes mas que mirar por internet y encontrarás varios ejemplos parecidos de como crear un MVC personalizado a tu gusto para que asi puedas entender mejor en que consiste y luego si quieres, lanzarte a estudiar algun framework MVC como Zend, CodeIgniter, Symfony, ...
Aqui tienes unos tutoriales de la creacion de un framework basico MVC en PHP que está muy bien.
http://dlancedu.com/
Un saludo.