A partir de la connection crea un prepearedstatement poniendo interrogantes en los valores del array
Rellena los interrogantes con valores
Código java:
Ver originalp.setBoolean(1, array[0]);
p.setBoolean(2, array[1]);
y ejecuta
He puesto boolean porque al ser checkbox entiendo que son boolean, si no, usa el método adecuado para el tipo de columna y dato que tengas.
Se bueno.