Patilanz,
Cita: "Hola necesito crear un programa de tal manera que cada vez que se registre un usuario crea un archivo que sera ..."
PHP (?)
fopen, fwrite, fclose "búscalo en php.net"
Lo que esta haciendo esta mal, en muchos conceptos, tamaño, inodos File Sistem, y mas.
Utiliza Base de datos y una pagina PHP. no una pagina por usuario.
Si bien, no te doy una solución, te anticipo que lo que haces esta MAL!.