Para encontrale sentido a tu explicación deberíamos ver que hace tu script Consulta().
Pero supongo que lo que te está pasando es porque estás recargando la página, deberías hacerlo con ajax.
Yo tengo hecho un sistema que hace algo similar
http://emprear.com/polling/
La diferencia fundamental es que solo actualiza si se ingresaron nuevos registros, y lo de la notificación es completamente opcional
Saludos