Son conceptos diferentes, yo tengo entendido más allá de lo que diga Wikipedia (todo bien con Wikipedia pero no es
la fuente de información) que una
marca de agua, es una firma a modo de imagen o texto (ya sea logo, url, etc) que se pone sobre una imagen o video para decir o aclarar que es "tuyo", o un "trabajo de tu autoría", se le dice marca de agua porque tiene una visibilidad difusa sobre el archivo original. Otra cosa es una
firma digital, esta se suele poner en los softwares o por ejemplo se puede setear para que una cámara de fotos adjunte en cada foto que se saca una firma determinada oculta, pero sin la validación de certificado digital podría verse más teoricamente como una "marca de agua".
Otra cosa es un logotipo, isotipo o isologotipo... y otra cosa es poner una url al pie de un sitio web hecho por vos.
Si bien podemos debatir sobre nuevos conceptos y la evolución de los mismos hasta el hoy en día, es lo que entiendo yo en cuanto a cultura general y lógica, saludos
