Puedes cambiar la consulta por esto:
Código PHP:
Ver original$codigo = $_GET['id'];
$sqT = "SELECT usuario.usuario,asignatura.nombre_asig,
notas.nota1 , notas.nota2 , notas.nota3 , notas.nota4
FROM usuario INNER JOIN notas INNER JOIN asignatura
ON usuario.usuario = notas.rut_alumnos
AND asignatura.cod_asig= ".$codigo;
Saludos!