En el manual original:
Código Javascript
:
Ver original<script src="prototype.js"></script>
<script src="jquery.js"></script>
<script>
jQuery.noConflict();
// Use jQuery via jQuery(...)
jQuery(document).ready(function(){
jQuery("div").hide();
});
.....
Carga lightbox primero y luego antes de código haz el no conflict a ver si te funciona.