Pues depende que tan restrictivo sea la base de datos que estan utilizando. Conoces el concepto de OBDC?
http://www.desarrolloweb.com/faq/que-es-odbc.html
Este permite interconectar bases de datos en microsoft con otras aplicaciones. Como no se en que esta hecho el software que comentas no se si ese modelo les sirva para interconectar la base de datos o no.
Solo conozco ODBC para conectar archivos .mdb con php. No se si exista algun modelo parecido para otros tipos de bases de datos.