Primero que nada, esta consulta deberias postearla en el foro Linux.
Cita:
Iniciado por xoceunder ...al cerar mi terminal de putty deja de funcionar de que forma puedo hacer que siga funcionando al cerar el terminal putty
utiliza el comando
nohup seguido del comando java y finaliza con un &:
Eso te liberara la consola y podras cerrar el putty sin que finalize la ejecucion del script.
Suerte!