Oohh... Interesante.
No he probado esta cosa, pero tal vez te sirva. (Es lo primero que encontré escribiendo svg 2 swf)
http://svg2swf.sourceforge.net/
O esto
http://gtrebaol.free.fr/doc/svgopen/2008/index.html
Y si ls pdf si te agarran la transarencia, trata usando pdf creator, solo ten cuidado de no instalar la barra de ask.
Tal vez eso.