Cita:
Iniciado por kitune 
Resumiendo:
- Pongo canonical que apunte a la dirección larga que será la primera y más antigua, incluso en algunos casos la única que haya.
Sólo habrá una URL, el canonical deberá apuntar al que toque, para los no modificados a la URL larga que es la única existente. En los modificados a la corta, que también es la única que existe. Ya que la otra al redireccionarse debe desaparecer en los indices de Google y transferir sus enlaces a la nueva.
En realidad el canonical no se utiliza para solucionar el problema de duplicidad, ya que no existe. Aunque no está mal ponerlo para evitar problemas si se enlaza con las www o sin ellas.
Cita:
Iniciado por kitune - En el php reviso si existe una url corta para una determinada petición y hago un 301 a la corta.
Esto sí está bien.