Después de leer el comentario de mogurbon, creo que el problema si es el CONCAT, si alguno de tus valores es null todo el resultado del concat será null, prueba cambiando esta línea en tu query:
Código SQL:
Ver originalCONCAT(etiquetas_muestras.tc,'-',etiquetas_muestras.at,'-',etiquetas_muestras.cbl,'-',etiquetas_muestras.h,'-',etiquetas_muestras.l)AS muestrasI
Por esta
Código SQL:
Ver originalCONCAT(IFNULL(etiquetas_muestras.tc, ''),'-',IFNULL(etiquetas_muestras.at, ''),'-',IFNULL(etiquetas_muestras.cbl, ''),'-',IFNULL(etiquetas_muestras.h, ''),'-',IFNULL(etiquetas_muestras.l, ''))AS muestrasI
Más los cambios que ya te había mencionado en el comentario anterior