josemari,
debes introducir el código fuente en la plantilla original o no DW no te dejará modificar un área no editable.
No hace falta luego que actualices todas las páginas basadas en esa plantilla. Luego en la página en cuestión en donde quieras usar el script le pides Modificar/Plantillas/Actualizar plantilla (o algo parecido).
Otra opción es pegarle el código a la página desde fuera de DW, por ejemplo, visualizar en explorer y pedirle el código fuente y desde allí (block de notas) modificarlo.
Eso si, en el momento en que vuelvas a actualizar desde la plantilla te lo quitaría de nuevo. Por eso mejor que el script lo tenga yá la propia template
