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Iniciado por Marvin 
Tendrias que usar una funcion que llame a otra pagina php a la que le envies los datos y te entregue el resultado para mostrar el mapa.
Podrias intentar con un load() de jquery.
Desde javascript con otro metodo no podras hacerlo a menos que recargues la pagina.
Saludos!
gracias , me ayudastes a darme una mejor idea y no estar tratando de pasar de javascript a php, al final lo hice da la siguiente manera
$("#municipio").change(function(){
var key=$("#municipio").val();
$('#mapaArgentina').mapster('set',true,key);
$.post("recuperar.php", {
municiopio:$("#municipio").val()}
,function(data){
$("#selections").html(data)}
);
luego en recuperar.php recibi el municipio seleccionado e hice la consulta
<?php
$muni=$_POST["departamento"];
require("FuncionesSQL.php");
$r_mun=new FuncionesSQL();
$id_dep= $r_mun->SeleccionarID("municipios","id_municipio","nombre ='".$muni."'");
$municipios=$r_mun->SeleccionarMunicipios("municipios","poblacion,nom bre","id_municipio="."'$id_dep'");
foreach($municipios as $noo){
echo $noo['nombre'];
echo '<br>';
echo $noo['poblacion'];
} ?>
saludos y gracias por la ayuda