Hola:
Cuando hablamos de Ajax: puede ser "accesible" (puedes verlo en mis enlaces)... Si quieres tener una buena posición en google, rastreará tu página buscando enlaces... y también rastreará esos enlaces... y los del tipo href="#" o "javascript
:lo_que_sea()" pueden provocar una penalización (no soy experto en SEO, pero me intereso bastante)...
... Además, no veo en mis respuestas (y en otras respuestas de este tema), que descarte(mos) el uso de javascript, sino que no hagas dos (2) versiones de una página (¡quién habla de retrógrada!), sino que sepas adaptar a una página normal sin javascript, las funcionalidades del lenguaje sin discriminar ni dejar de mostrar lo bueno que eres con el lenguaje (supongo que debe ser un auténtico delito entrar a alguna de tus páginas desactivando javascript)...
Saludos