El tema entonces es que en el indice 0 del array te guarda todos los mails separados por un espacio, por lo tanto hace esto:
Proba así entonces:
Código PHP:
$length = 1000;
while ( ( $data = fgetcsv( $handle, $length) ) !== FALSE )
{
$cadena_final=str_replace(' ',',',$datä[0]);
}
fclose($handle);
echo $cadena_final;