Hola apicao:
Bienvenido al Foro.
Al decir:
Cita: tengo un problema que al abrir un html que contiene unos videos en .flv en mi servidor funcionan correctamente
Entonces ya está en la web, posiblemente haz querido decir que en local si funciona, si es así es posible que al servidor no hayas subido el skin.swf y el video.flv o que las rutas a esos archivos no estén bien.
Espero haberte sido de ayuda.