ten en cuenta que sqllite para móviles depende de la capa de abstracción de donde accedas a él, es decir, el SDK de Android lo implementa de una forma, pero desde el Navegador se implementa desde HTML5 LocalStorage, por lo tanto es probable que la forma en que lo hagas en PHP difiera, lo que no cambia obviamente, es la estructura SQL genérica.
así que no te limites a sólo usar sqlite en PHP, aprende directamente de la API que pretendas usar, hasta PhoneGap (cordova) dispone de una capa de alto nivel para implementarlo, saludos