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Iniciado por gnzsoloyo 
¿Eliminas los campos o los registros?
Partamos d ela base que una exportación de la estructura no reinicia los autoincrementales de las tablas que los posean, sino que conservan en su definición, los valores desde los que deben iniciar.
Esto significa que si exportas la estructura sin datos de una tabla que llegó hasta el autoincremental 123, el CREATE TABLE tendrá indicado que inicie desde el 124.
Hay sólo dos formas de reiniciar las numeraciones: 1) Truncar las tablas, 2) Modificar las tablas para cambiar el valor de inicio.
Hola gonzsoloyo gracias por tu colaboracion, sobre el tema decirte que si que elimino los campos que tienen clave primaria, sobre las posibles soluciones probe la 2 modificando todas las tablas para que no me las tenga en cuenta mysql pero tampoco es aqui lo que me estraño mucho, sobre truncar las tablas no se a que te refieres, un saludo.