A mí personalmente nunca me ha gustado demasiado flash. Si, hace unas animaciones muy buenas, pero una web es una web. Es como quienes abusan hoy de jQuery/CSS moviéndose todo.
De todas formas, no creo que desaparezca tan fácilmente. HTML5 sí, tiene buenas cosas, pero flash tendrá mejores seguramente. Y las páginas web mañana requerirán cosas más potentes que no podrá hacer HTML5, y luego estaremos esperando a HTML7 e igual desaparece flash pero vienen dos cosas mejores... Lo único que está claro, es que las cosas al final desaparecen.
Y es bueno. Imagínate Twitter y Facebook lleno de applets de Java, gif's animados, iframes y Comic Sans —bueno, de esto último nunca nos desharemos...