Bueno despues de apartar este proyecto un tiempo he vuelto a retomarlo hoy y he dado con la solución.
Código PHP:
$matriz=$_POST['tester'];
mostrar(array_unique($matriz));
function mostrar($matriz)
{
foreach ($matriz as $id){consulta}
Sólo tuve que añadir esto antes de la consulta, cuantos dolores de cabeza me provocó este problema, y ahora que lo veo es absurdo.
Espero ahorrarle el dolor de cabeza a otros.