Bueno, sigo con mis memorias...
Al final pude resolverlo después de buscar por todas las herramientas de
object, haciendo uso de algo llamado
flatten transparency, una vez aplicado a los segmentos distorsionados, vuelvo a hacer
compound path con esos segmentos y ya hago la división con
pathfinder.
Si alguien deja una explicación más técnica sabré porqué funcionó.
