Cita: If you have ever tried to repartition a LINUX disk back into a DOS/Windows disk, you will know that DOS/Windows FDISK has bugs in it that prevent it from recreating the partition table. A quick
dd if=/dev/zero of=/dev/hda bs=1024 count=10240
will write zeros to the first 10 megabytes of your first IDE drive. This will wipe out the partition table as well as any file system information and give you a ``brand new'' disk.
Eso de arriba citado de RUTE (
http://rute.sf.net/). Suponiendo que /dev/hda es el disco duro en cuestión y que éste está como maestro en el IDE1.
Puedes arrancar con un Linux live CD como Knoppix para ejecutar este comando.
Mucha suerte.
Un saludo,