Hola:
Evidentemente puse mal la condición... no existe el atributo check sino "checked"; y no debes poner una alerta por cada paso del bucle, sino acumular en una variable el resultado... u obtener el valor lógico acumulado...
checkeados = 0;
for (i = 0, checks = document.forms[form1]["PRS_PLAN[]"]; i < checks.length; i++)
{
if(checks[i].checked){checkeados++;}
}
// aquí la consulta de checkeados...
Saludos