problema con height y porcentajes

[pepinero]

Resulta que el problema más comun que tengo con el height en %, es con los menus, que se me descuadran o directamente desaparecen, y el tema de poner todo en % es porque ultimamente leo en todas partes que es mejor diseñar en % por el tema de las distintas resoluciones, al final yo creo que utilizare los px para menus o em, porque sino me voy a volver loco.
Un saludo.