Hola:
Como no tengo idea de jquery te respondo sobre lo tradicional.
si el nombre de la variable es js_porcentaje_1, php recibe su value con $_POST[js_porcentaje_1], y es una variable de texto normal, pero si quieres que reciba un array (suele hacerse), en el formulario, el nombre de la variable debería ser "js_porcentaje[]". Fíjate en el juego de corchetes al final del nombre, y en php debes recibir la variable $_POST["js_porcentaje"] (en php sin el juego de corchetes) y el tipo de esa variable será un array... y ya lo manejas con php como array (count, y su indexación).
Por eso te comenté lo de print_r.
Y asegúrate de que el método sea post.
Con javascript podrías mirar el "innerHTML" del formulario para comprobar que los nombres y valores sean los adecuados.
Saludos