Varias bases de datos

[gnzsoloyo]

En primer lugar, un mismo servidor puede contener múltiples bases de datos. Para eso se diseñaron, y no para trabajar una única BBD por server...
Por otro lado, si las dos bases están en el mismo servidor, y los mismos usuarios pueden acceder a ambas, no hay ningún impedimento para usar la misma conexión. Lo que se complica son las consultas, ya que en cada ocasión que se consulte tablas que no estén el la BBDD de la conexión, se deberá indicar en la consulta a qué tabla de qué base se está invocando en el FROM.
Respecto a la performance, es muy variable, hay muchas cosas a tener en cuenta para poder responder: Diseño, carga de datos en cada base, cardinalidad de las tablas, sintaxis de las consultas, espacio de tablas disponible, indexaciones, etc., etc.
Sin que nos des muchos detalles más no se puede saber, a priori, si usar dos bases mejorará o empeorará la performance. Además, lo que hay que establecer es si realmente es necesario usar dos bases, ya que si se trata de separar en dos lso componentes de un mismo sistema, eso no implica que deben existir dos bases, sino un mejor diseño.

En otras palabras: Con lo que nos dices, no hay un consejo puntual que se pueda dar con certeza. Deberíamos conocer mejor el caso.