Tu inquietud la hemos respondido con anterioridad varias veces ya en el foro.
Se trata de utilizar enlaces absolutos (URL completa) o relativos (URL relativa con respecto al documento actual) en el linking interno.
Este tema siempre ha sido debatible; ya que se encuentran tantas opiniones a favor de los enlaces absolutos como, por otro lado, otras tantas con el uso de los enlaces relativos.
De cara al SEO, cualquiera de las 2 modalidades puede ser seguida—adecuadamente—por los crawlers y/o bots que rastrean e indexan tu sitio. De esta manera, existen las mismas posibilidades de indexación y no te quita ni te agrega nada utilizar una u otra modalidad.
Finalmente, una recomendación. Cuando ponés como ejemplo:
home/servicios-generales/saneamiento_ambiental/index.html
Te recomiendo la siguiente arquitectura de URL
/servicios-generales/saneamiento_ambiental.html
