Si, podés hacerlo utilizando javascript para controlar la reproducción
Aqui te dejo algunas demos y pruebas, una es para un reproductor de video, pero basicamente el lo mismo, tiene alguno bugs, pero es tan solo un experimento (la idea es hacerlo sin recurrir a ningúna librería o script auxiliar)
http://foros.emprear.com/html5/vplay...o-html5_g.html
los otros son ejemplos con audio, uno para controlar el volumen,
http://foros.emprear.com/html5/audio...o-html5-v.html
el otro detiene y reproduce alternadamente 2 archivos
http://foros.emprear.com/html5/audio...p3/audio5.html
Analizá el código fuente
También podés consultar
http://www.w3schools.com/html5/html5_ref_av_dom.asp
y guías similares que se encuentran en google
http://www.position-absolute.com/art...-manipulation/
Hay que andar con algún cuidado, porque los métodos no funiconan en todos los browsers, asi como tampoco los atributos de la etiqueta
Saludos