te dejé 2 ejemplos
http://foros.emprear.com/javascript/nueva_ventana/
a mi me funcionan
ahora lo que confunde un poco de tu enunciado es lo de
una ventana/pestaña nueva
Ya que una pestaña no es un popup, por otra parte la decisción de que una nueva ventana del navegador se habra en una nueva pestaña o una nueva ventana depende de la configuración del navegador.
De todas maneras, asi sea con un link con target _blank, a mi en todos los navegadores, (Chrome, Safari, IE) el foco queda en la pestaña abierta, y en la otra pestaña continúa la página original, no veo diferencia