El flag P indica que Apache está trabajando como un proxy, en que puede afectar tus reglas, no sé , tendría que hacer un detalle mucho más extenso de tu configuración.
Cita: Existe algún flag de rewriterule que mantenga luego de cargar la URL amigable aún mostrando el continedo de la página dinámica ???
No termino de entender la pregunta
una url amigable es justamente por definición eso,
mostrar una ruta ó url virtual apuntando y mostrando los resultados de una dirección física
Saludos