Query para encontrar datos existentes en 2 instancias remotas

[Libras]

acorta tus datos en el where.........estas filtrando bien en tu join?

Código SQL:

CREATE TABLE #temp1
(
id INT
)
 
CREATE TABLE #temp2
(
id INT
)
 
 
INSERT INTO #temp1 VALUES (1)
INSERT INTO #temp1 VALUES (2)
INSERT INTO #temp1 VALUES (3)
INSERT INTO #temp1 VALUES (4)
 
INSERT INTO #temp2 VALUES (1)
INSERT INTO #temp2 VALUES (1)
INSERT INTO #temp2 VALUES (5)
INSERT INTO #temp2 VALUES (6)
 
SELECT * FROM #temp1 AS t1
LEFT JOIN #temp2 AS t2 ON (t1.id=t2.id)
WHERE t2.id IS NULL
 

el resultado de esta consulta es 2,3,4 que son los que no estan en #temp2