Al parecer es un problema de la API
http://code.google.com/p/javaapifork...s/detail?id=28 Cita: Java 6 includes a JAXB implementation which is not JAXB RI so if you want to rely on a JAXB RI specific feature you should bundle it.
Es un problema de versiones
En caso de que no te sirvan, si solo pretendes crear un xml, puedes conseguir uno de ejemplo y montar su propio marshaller.