HTML cubre sólo formatos básicos y carece de controles, pero con HTML5 puedes tener mayor control a excepción de que requieres que el navegador del cliente cuente con dicho codec, es por ello que la alternativa de reproductores en flash es tentadora.
en tal caso comienza por investigar sobre manejo de audio en HTML5, seguro consigues lo que necesitas, además de plugins como jQueryMedia que lo hacen aún más fácil, suerte
