usar document.write no es la vía más optima para crear la estructura de un select, en tu caso como usas php puedes perfectamente crear los <option> desde php.
en javascript puedes generar la estructura del select en una variable string y añadirla al innerHTML de un <div> por ejemplo, es la forma que funciona en todos los navegadores, debido a que usar appedChild no funciona en algunos.
consulte sobre "selects" dependientes php/ajax, aunque no use AJAX puede aplicar el principio