Hola,
 
Prueba así:    
Código Javascript
:
Ver original- $( "#combobox" ).autocomplete({ 
-         change: function(event, ui) {  
-         if($(this).val()=='Todos'){ 
-             $('.aulaRes').each( function() { 
-                 this.checked = true; 
-             })         
-         } 
-         if($(this).val()=='Nada'){ 
-             $('.aulaRes').each( function() { 
-                 this.checked = true; 
-             })         
-         } } 
-     }); 
O también puedes probar con 
ui.item.value en lugar de 
$(this).val().  
Saludos.