Pues no viste bien. Apenas entrás a la página te da opción de descargar la versión Flash o la HTML5.
Lamentablemente la versión HTML5 no es gratuita.
Si buscás en Google "HTML5 ajax file upload" o algo así, seguramente encontrarás algo de ayuda. (ejemplo, un mega tutorial muy completo y extenso:
http://www.matlus.com/html5-file-upload-with-progress/ )
El problema acá es la baja compatibilidad con navegadores. Si tanto te interesa hacerlo así, no le veo lo malo a usar flash.
Este tiene hasta drag & drop (HTML5)
http://www.sitepoint.com/html5-ajax-file-upload/