Cita:
Iniciado por Ricardfs 
Creo que estamos equivocando conceptos, el nofollow nada o poco tiene que ver con la indexacion, Google sigue los enlaces nofollow como sigue los dofollow.
Crea una pagina y enlazalo únicamente con enlaces nofollow y espera unos días a que sea indexado, en esos casos ni googlebot visita la pagina, y menos aún, cuando el nofollow lo agregas en tu pagina hacia un enlace externo.
Sin embargo, al saber que tu página le está haciendo referencia, si le ayuda a subir posiciones, pero no transfiere el tan cotizado PR, que en la mayoría de los casos, no le suma valor al posicinamiento.
Pero en fin, en respuesta a la pregunta, no es recomendable el nofollow interno, tal cómo te lo han dicho, sería mejor encontrar otra función que permita agregar sólo a los externos, o bien y aúnque sea largo el trabajo, agregarlo manual.