Muchísimas gracias!!!!
Me quedó más o menos claro.
La idea que tengo es que compartan las tablas, tengo una tabla Clientes que estará tanto en la aplicación de escritorio como la web, es decir, será para ambas aplicaciones.
Si ya tengo hecha la aplicación Java, cuanda haga la web con Joomla entonces debería modificar el código Java??
Muchas gracias por tu atención!!!