El problema no es del TinyMCE, sino del contenido dentro del textarea, que no debe ser HTML, porque el navegador lo tratará de interpretar y mostrar como parte de la página.
Código PHP:
Ver original$codigo = '<ul><li>Lista no ordenada</li></ul>';
// Mal:
echo '<textarea name="texto">' . $codigo . '</textarea>';
// Bien:
echo '<textarea name="texto">' . htmlentities($codigo) . '</textarea>';
Con htmlentities conviertes todos los caracteres especiales en sus respectivas entidades HTML, de forma que puedas incluirlos como valor en el textarea y quedando algo como:
Código HTML:
Ver original <ul><li>Lista no ordenada</li></ul>