limpiar select despues de enviar datos mediante ajax

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Con el código que tienes, mira cómo funciona

http://jsbin.com/ejipuy/3/edit#javascript,html,live

Así que el problema está en que la función cargar_usuarios() modifica de alguna manera el select y sus opciones o que sucede un error de JS.

Revisa ambas cosas. Para la primera, basta con que coloques la línea de código de antes al final de la función cargar_usuarios() y la otra simplemente abriendo la consola de comandos.