Resuelto, para los que tuvieron el mismo problema,
La clave esta en la opcion "preserveViewport: true" de las opciones del kml layer, con esto respetará el zoom y center que se le asigno previamente al Map...
Código Javascript
:
Ver originalaction: 'addKmlLayer',
url: "http://www.mysite.com/myrut.kml",
options: {
suppressInfoWindows: false,
preserveViewport: true
}
}