Hola,
Pero... ¿para administrar online o desde tu ordenador?
Si te refieres administrar tus bases de datos (eso sí, por línea de comandos) usa: mysql (el programa se llama así, y tienes que insertar tus querys por la línea de comandos).
Si te refieres a online para administrar bd's de forma visual usa PHPMyadmin. Es open source y está en español, y te permite administrarla totalmente.
Saludos
