Error en direccionamiento

[Nemutagk]

Eso no es problema del servidor, es problema de como están hechos los links, este jamás va a apuntar a la raiz del sitio, al no indicar con una diagonal al inicio indicas que el archivo esta al mismo nivel del que lo esta llamando o en su defecto un nivel mas bajo, ejemplo...

supongamos que lo llamas desde...

localhost/path1/path2/archivo.html

el link tal cual crearía un hipervinculo al archivo...

localhost/path1/path2/carrito.php

en cambio, si le agregas una diagonal indicarás al navegador que el archivo se encuentra en raiz por lo que quedaría...

localhost/carrito.php

Ahora, si antes ambos enlaces enviaban a un archivo en raiz probablemente tenian alguna regla en el mod rewrite, sin esto es ilógico lo que dices...