Perdida de variables en includes

[gzanitti]

Buenas. Tengo un problema con varios include y un menú.
La idea, a grandes rasgos es, un index con un menú y un div donde se hacen diferentes includes. Pensé en hacerlo lo mas dinámico posible y no perder tiempo recargando toda la pagina, sino que solo se actualice el contenido del div de acuerdo al botón apretado.

Pense en hacer los "cambios" de los includes con JavaScript, pero como estoy utilizando una session de php (que se abre en el index, porque tambien se usa en este, asi que reabrir sesiones en cada include no es una solucion) y este corre del lado del cliente, pierdo los cambios que hago en las variables de php.

Existe alguna solucion practica? O la unica salida es recargar toda la pagina en cada click del menu?
Busque bastante por internet sobre "includes dinamicos" pero no entendi demasiado y como lo que estoy haciendo es mas para aprender que otra cosa, no apliqué demasiado a eso de "copiar y pegar".

Saludos.
No se si este era el lugar correcto para la pregunta, pero bueno, cualquier cosa muevan sin miedo :).