Bien, logre aparentemente algo que funciona.
Ajax, por alguna razón que desconocemos, vuelca el código que viene desde el servidor, en la div que le indiquemos. Pero... como hemos visto, modifica la css de la div en cuestión, provocando ciertos errores gráficos.
Lo que he hecho es, como última instrucción del código html generado en el servidor, es unas líneas jQuery que modifiquen las css de dicha div. Entonces tendría algo asi:
mi html:
<div id='dinamica'>
</div>
el php devuelve algo asi:
<table id='pirulo'>
.......
</table>
<script>$("#dinamica").css({ "margin-left": "0px", "margin-top": "0px" });</script>
...y pues.. con eso ha funcionado por ahora.
:)